E' un problema un po' strano.
Certo inizializzare sarebbe una prova da fare, e nemmeno con la matematica certezza che il problema non ti si ripresenti, nel malagurata ipotesi che fosse un danno Hardware.
Inizializzare, nel tuo caso, dovresti farlo senza utilizzare il Backup, per non portarti l'eventuale problema dietro.
A questo punto, io ti consiglio, visto che il problema non è così grave (al massimo riavvii momentaneamente) aspetta qualche giorno, perché a Luglio esce Mountain Lion, così installi direttamente quest'ultimo