Tempo fa capitava abbastanza spesso ed era l'indice di spotlight rovinato. Era sufficiente avviare in modalità sicura (tasto maiuscole all'avvio), aprire le preferenze di sistema, spotlight, inserire l'intero disco nella sezione privacy (il che cancellava l'indice di spotlight dal disco), riavviare normalmente, e togliere il disco dal pannello privacy di spotlight.
Non mi è più successo dal 10.6 in avanti, ma penso possa esserti di aiuto questa info.
Fammi sapere, anche solo per curiosità!