Devi avere un computer che possa avviare dallo stesso sistema operativo, ovvero El Capitan, al quale vai a collegare il disco su cui vuoi installare il sistema.
Una volta scaricato l'installer di El Capitan hai due possibilità, e io partirei da quella più semplice se fila tutto liscio:
- apri l'installer e fai l'installazione di El Capitan sul disco esterno
- una volta terminata riavvii scegliendo come disco di avvio quello esterno, configuri l'utente pensando che sarà quello del Mac Pro facendo poco altro e non mettere nessuna password per l'avvio del utente
- apri App Store per vedere se c'è qualche aggiornamento, lo fai e poi fai un ulteriore riavvio per verificare che sia tutto a posto e automatico
Se tutto va a buon fine spegni tutto, stacchi il disco e lo metti dentro il Mac Pro, incroci le dita e lo avvii.
------------
Se non dovesse funzionare questa tecnica di installazione, allora devi usare la seconda possibilità, ovvero quella di creare un disco di avvio e installazione che userai per fare il tutto, che non può essere ovviamente il disco di destinazione finale.
Di solito si usa una pennetta da (almeno) 16 Gb, che prepari seguendo questa procedura
https://support.apple.com/it-it/HT201372
A quel punto collegherai al mac sano sia il disco esterno che la pennetta, all'avvio tieni premuto il tasto Alt e scegli la pennetta come disco di avvio. A quel punto partirà un sistema minimo che poi effettua anche l'installazione.
Al termine della procedura riavvierai andando a scegliere il nuovo disco di avvio, fai i controlli citati prima e quando il disco di avvio funziona bene e avvia in modo autonomo sei pronto per spostarlo nel Mac Pro.