Ciao a tutti, ho risolto il problema modificando i permessi ai certificati, come scritto sopra.
Dall'accesso al portachiavi ai certificati "VeriSign Class 3 Public Primari Certification Authority" ho modificato l'autorizzazione SSL in "Fidati sempre". Stessa discorso per "Policy di base X.509".
A questo punto funziona sia App Store che il login su Safari.
Un saluto, alla prossima